نرم‌افزار رایانه‌ای تحت وب تشخیص گونه‌های قارچی (FUNGID)، مطالعه موردی: جنس Phaeoacremonium
کد مقاله : 1274-FIPPC (R2)
نویسندگان:
محدثه فرشباف بدر *1، سمانه نوریان بارانلو2، علی چناری بوکت3، علیرضا علیزاده4
1دانشجوی کارشناسی گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه شهیدمدنی اذربایحان
2دانشجوی کارشناسی گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید مدنی اذربایجان
3استادیار، سازمان تحقیقات آموزش و ترویج کشاورزی
4استادیار گروه گیاهپزشکی دانشکده کشاورزی دانشگاه شهید مدنی اذربایجان
چکیده مقاله:
به منظور تسهیل در شناسایی گونه‌های قارچ‌ها یک نرم‌افزار بر پایه وب طراحی گردید. بخش اول این برنامه برای تشخیص گونه‌ های جنس Pythium طراحی گردیده بود و اکنون بخش دوم آن برای تعدادی از گونه ‌های جنس Phaeoacremonium آماده شده است. این برنامه به راحتی در رایانه ‌های شخصی با حداقل امکانات سخت‌ افزاری و نرم‌ افزاری قابل راه‌اندازی می‌باشد. این برنامه می‌تواند توسط کاربر ویرایش گردد و با وارد ساختن صفات ریخت‌شناختی و داده‌ های ریخت سنجی گونه ناشناخته در بخش جستجو (search)، تعدادی از گونه ‌های ثبت شده در پایگاه داده به عنوان گونه‌های احتمالی به کاربر پیشنهاد و وی براساس توصیف گونه‌های پیشنهادی و سایر اطلاعات ضمیمه به انتخاب یکی از گونه‌ها راهنمایی می‌شود. این برنامه در زبان برنامه‌نویسی تحت وب ASP.NET توسعه یافته است. پایگاه داده باSQL.SERVER پشتیبانی می‌شود و به راحتی و به صورت رایگان در دسترس است. در این نرمافزار برای هریک از گونه‌های جنسPhaeoacremonium صفات ریخت شناسی و داده‌های ریخت سنجی شامل رنگ کلنی در محیط MEA، ساختار کنیدیوفور، حداقل و حداکثر طول کنیدیوفور، نوع فیالید، توالیDNA که قبلا در GenBank برای گونههای جنس Phaeoacremonium ثبت گردیده، مشخص شده‌اند. این برنامه قابل گسترش به سایر ارگانیسم‌ها مانند کنه‌ها، حشرات، نماتدهای انگل و غیر انگل گیاهی، باکتری‌ها و سایر قارچ‌ها و شبه‌قارچ‌ها نیز می‌باشد. به حالت آسان برای استفاده (user friendly) طراحی شده، از طریق وبگاهwww.fungid.ir قابل دستیابی بوده و اولین برنامه تحت وب تشخیص ریخت‌شناختی گونه‌های قارچی با تاکید بر گونه‌های جنس Phaeoacremonium است که در ایران پردازش و معرفی گردیده است.
کلیدواژه ها:
Phaeoacremonium
وضعیت : مقاله برای ارائه به صورت پوستر پذیرفته شده است